美反补贴调查机构为商务部和国际贸易委员会。美商务部下设国际贸易局(International Trade Administration),其下的“进口管理局”(Import Administration)主管反补贴调查事务。目前,进口管理局设有专门用来协调中国及非市场经济国家事务的高级主管(Senior Director for China/NMEEnforcement Coordinator)和两个专管中国和非市场经济国家的反倾销、反补贴执行办公室。国际贸易委员会下设“主任办公室”(Operations Office of the Director),其下设的“不公平进口调查办公室”(Office of Unfair Import Investigation)负责反补贴的损害调查。
委员会针对每一起反补贴调查会成立一个六人调查组,其中包括一名调查员、一名经济学家、一名会计/审计师、一名产业分析师、一名律师和一名督导调查员。调查组负责进行事实调查,委员会法律顾问提供法律意见,最终由各个国际贸易委员通过投票作出裁定。